玉妥萨玛云丹贡布诞生于藏历第二绕迥，火马年（公元1126年）西藏江孜县郭西热塘地方。父名玉妥琼波多吉，母名白玛俄丹。

　　他从幼年开始随父亲学习藏文读写。从八岁起学习十明，特别是专心功读医学论著，学业优良，努力实践，从青年时就有声名。

　　玉妥萨玛云丹贡布系为玉妥宁玛的第十三代后裔。根据第司·桑杰嘉措在《后续蓝琉璃》跋文中记载玉妥萨玛与促郭巴·杰瓦迥乃为同一时期人物。后得五世达赖喇嘛施恩，木刻其传记并存于甘丹平措林寺的木刻版中。玉妥萨玛先后以各种奇特神通，六次周游印度，尼泊尔和斯里兰卡等国家。上半生主要以研习传授医学八支集要为主，以后拜卫巴达扎和绕郭贡曲嘉为师，学完《四部医典》的全部内容，暂以独承方式进行研习。亲自接见了空行母之主白丹成瓦及扎热嘎仙人等众多大学者、大成就者，并得到无数妙决亲传。返回故乡后行医济世，广收门徒，盛时门徒相娶达三百余人。著述甚丰，玉妥萨玛经过比较研究当时在雪域流传的所有的医学黄籍的基础上，首先撰写了分五年部分的医书《探病脉诊学》一书。此后编写了《切脉准则·普顿玛》、《小续甘露精要》、《玉妥药珍十八支》，同时还编撰了收录199种药材的《大本草》及《秘决宝藏之瓶》、《十万拳头》等许多著作，特别是玉妥萨玛云丹贡布根据当时的需要对《根本医典》的某些章节和《论说医典》中的饮、茶，药食等章节进行了补充。尤其对医学八支内容的精华部分也进行汇总和编辑。特别是用厘定后的藏文必定《四部医典》，加入注释，斟酌时地差另，随宜补遗，用实践医诀加以充实，使《四部医典》成了更加完善、丰富的医药学臣著。该圣者的相随弟子多如满天星。其中最有名的为松顿·益希松。玉妥萨玛云丹贡布把《四部医典》传授给了这位得意弟子。松顿在先后编写了《玉妥传·五体自成》及《论说医典释·小集明灯》等著作，同时大大弘扬了《四部医典》的内容。

　　玉妥萨玛云丹贡布在藏医药学上有很大的成就，对藏医的发展功著誉盛。于公元1193年去世，率年76岁。